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클러스터링 알고리즘은 클러스터가 물리적으로 의미 있는 상태에 해당하는지 여부를 평가하지 않고, 단순히 국소적으로 밀도가 높은 영역을 기반으로 데이터를 분할한다는 점에 유의해야 합니다. 이 프로토콜은 데이터를 가우시안 혼합 모델로 표현하며, 최적의 클러스터 개수는 적합도, 모델 복잡성, 분류 불확실성의 균형을 맞추는 여러 IC 지표(AIC, BIC, ICL)를 사용하여 결정합니다. 일반적으로 SMS 데이터 세트는 고유한 노이즈와 측정 불확실성으로 인해 IC 점수 플롯에서 단일 단조 추세보다는 여러 개의 변곡점이 나타나는 경우가 많습니다. 전역 최소값이 통계적으로 가장 적합한 결과를 제공하지만, 실험 데이터 세트에서는 비현실적으로 높은 클러스터 개수로 이어져 과도한 분할을 초래하고 물리적 해석 가능성을 저해할 수 있습니다(예: 그림 5E , 5F, 6D , 6E 참조). 클러스터링 알고리즘은 관련 IC 이득과 플롯에서의 급경사 하강법을 기반으로 최적의 후보를 자동으로 결정함으로써 주관성을 상당 부분 제거합니다. 모호성을 더욱 완화하기 위해, 평균 클러스터 밀집도와 FO(Focus of Information)와 같은 보조 클러스터 품질 지표를 IC 점수와 함께 평가합니다. 클러스터 밀집도는 차원 대비 밀집도를 정량화하고, FO는 신뢰 영역이 데이터 분포를 적절하게 포착하는지 평가합니다. 이 결합된 프레임워크는 IC 추세만으로는 최적해를 명확하게 식별할 수 없는 경우에도 선택된 솔루션이 통계적으로 일관성이 있고 해석 가능한지 확인합니다. Alexa Fluor 647 데이터 세트( 그림 5E 및 5F)에서는 여러 후보 솔루션이 존재하지만, 선택된 솔루션만이 적절한 밀집도와 데이터 커버리지를 동시에 유지하여 과분할을 방지하고 물리적으로 해석 가능한 결과를 제공합니다.
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