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<br/><br/>------------------- 이전글 -------------------<br/>분자 도킹 연구 슈뢰딩거 모음곡 LigPrep을 이용하여 Epik을 통해 양성자화 상태를 예측하고, 목표 생리적 pH인 7.0 ± 2.0에서 표적 천연 화합물의 다양한 입체 이성질체와 가능한 이온화 상태를 생성했습니다. 입체 이성질체는 유지하고, 저에너지 고리형 입체 이성질체를 샘플링했습니다. F 단백질 구조는 Protein Preparation Wizard를 사용하여 준비했으며, 이 과정에는 결합 차수 지정, 누락된 수소 원자 및 측쇄 추가, OPLS3e 힘장을 사용한 에너지 최소화가 포함되었습니다. 도킹을 위해 Grid Generation을 사용하여 표적 결합 부위 주변에 수용체 그리드를 생성했으며, 내부 상자는 10 Å × 10 Å × 10 Å, 외부 상자는 활성 부위 영역을 포함하도록 30 Å × 30 Å × 30 Å로 설정했습니다. 도킹은 Glide를 사용하여 표준 정밀도(SP) 및 초정밀(XP) 모드 모두에서 수행했습니다. 기본 도킹 매개변수를 사용했으며, 유연한 리간드 샘플링과 도킹 후 최소화를 적용했습니다. 도킹 점수, 결합 자세 및 2D/3D 상호 작용 다이어그램을 분석하여 화합물과 F 단백질 간의 주요 분자 상호 작용을 식별했습니다[ 23 ]. 2.4 분자 동역학 시뮬레이션 2.4.1 슈뢰딩거 데스몬드 XP 도킹에서 가장 높은 점수를 받은 리간드-단백질 복합체를 Desmond 패키지를 사용하여 MD 시뮬레이션에 적용했습니다. 복합체는 용질과 시뮬레이션 박스 가장자리 사이의 최소 완충 거리가 10 Å인 직교정계 시뮬레이션 박스에 삽입되었습니다. 시스템은 TIP3P 물 분자로 용매화되었고, Na + /Cl- 이온 을 첨가하여 시스템을 중화하고 생리 식염수 조건을 모방한 0.15 M 이온 강도를 시뮬레이션했습니다. <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--vk1b50ggwgsfq9mn1ns3qjvc.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">블랙티비</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://blacktv.isweb.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">블랙티비</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://blacktv24.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">블랙티비</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://blacktv99.clickn.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">블랙티비</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://wtv248.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">야구중계</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://totogal.net/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">토토갤</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--910br1nf9g2g92y.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">토토솔루션</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://gajimall.net/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">리얼돌</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://sports.clickn.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계사이트제작</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://liontv24.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="http://neartv24.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://toptv25.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://cardcash119.isweb.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">카드현금화</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--s39ax5ovthlweea6by25f.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">주식실시간디비</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--s39ax5ovthlweea6by25f.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">주식실시간DB</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--q20ba83d89ecxgo6hyxas5vy85b.isweb.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">상남동베트남노래방</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://cjfullcourse1.clickn.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">청주노래궁</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://somedayqq.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">어느날토토</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.manilaclark.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">마니라클락에이전시</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--q20blp60mv7e5qa520c13ij5m.isweb.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">창원베트남노래방</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--hz2b93s3ybrvj3wi9jc.isweb.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">포항출장마사지</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://pohangvisitmassage.isweb.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">포항출장마사지</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://ingyedongswedish.isweb.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">인계동 스웨디시</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--989a97k90a177abiai8sy2a.isweb.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">인계동 스웨디시</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.makangs.com/shop/%EB%A7%88%EC%82%AC%EC%A7%80/4511-%EC%88%98%EC%9B%90-%EC%9D%B8%EA%B3%84%EB%8F%99-%EC%98%A4%EC%9A%B0%EC%95%BC%EC%8A%A4%EC%9B%A8%EB%94%94%EC%8B%9C" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">인계동 스웨디시</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.gunmalove.com/bbs/board.php?bo_table=store&wr_id=212088" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">인계동 스웨디시</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.cheonanmultikaraoke.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">천안다국적노래방</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.google.co.kr/maps/place/%EB%8C%80%EA%B2%8C%EA%B6%81/data=!3m1!4b1!4m6!3m5!1s0x356726675199f9f9:0xbe2070fade3eab5e!8m2!3d36.3586307!4d129.3833628!16s%2Fg%2F1tm1nb1j?entry=ttu&g_ep=EgoyMDI1MDIxMC4wIKXMDSoJLDEwMjExMjMzSAFQAw%3D%3D" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">영덕대게 맛집</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--kj0bs60c.isweb.co.kr" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">급전</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://xn--kj0bs60c.isweb.co.kr" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">소액급전</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://gangnamperblick.clickn.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">강남 하이퍼블릭</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://gangnamperblick.clickn.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">강남 하퍼</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://seomyeonkaraoke.clickn.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">서면가라오케</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.flowstream77.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계제작</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://flowstream1.clickn.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계api</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://flowstream.clickn.co.kr/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계솔루션</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.spo-stream.com/" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계api</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.pft-stream.com" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계 커뮤니티 제작</span></a> <a class="seoquake-nofollow" href="https://www.pft-stream.com" rel="nofollow noreferrer noopener" style="font-size:0;line-height:0;text-decoration:none;" target="_blank"> <span style="color:rgb(255,255,255);font-family:LexiSaebomR;line-height:2;letter-spacing:1px;text-decoration:none;">스포츠중계api</span></a>
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